为了保障实验中心高效规范的运行，学校和学院制定了多项管理规章制度，学校实验室管理部门每年都对实验中心的教学情况进行审查和考核，对发现的问题督促中心限期整改，促进实验教学规范化。具体的管理制度包括：

1、实验室管理制度

《安徽理工大学实验室工作管理条例》

《安徽理工大学教学实验室建设管理方法》

《安徽理工大学实验室工作人员岗位职责》

《安徽理工大学实验室开放管理规定》

《安徽理工大学实验技术人员培训管理办法》

《安徽理工大学实验室工作基本信息收集整理制度》

《安徽理工大学实验室安全及卫生制度》

2、设备管理制度

《安徽理工大学实验室仪器设备管理制度》

《安徽理工大学仪器设备管理办法》

《安徽理工大学大型精密仪器设备管理办法》

《安徽理工大学化学危险品管理办法》

《安徽理工大学低值仪器设备管理办法》

《安徽理工大学仪器设备维修管理办法》

《安徽理工大学仪器设备损坏丢失赔偿办法》

《安徽理工大学大宗物资设备采购管理暂行办法》

《安徽理工大学自制教学仪器设备管理办法》

3、教学管理制度

《安徽理工大学实践教学工作管理规定》

《安徽理工大学实践教学各主要环节质量标准》

《安徽理工大学教学实验项目管理办法》

《安徽理工大学毕业设计、实验实习费经费使用管理细则》

《安徽理工大学实验及实践教学管理办法》

《安徽理工大学实验教学督导管理办法》

《安徽理工大学实验室工作考核办法》

《安徽理工大学校外实习基地管理办法》

《学生实验手册》

4、计算机科学与工程学院为加强中心管理，规范实验教学，还制定了一系管理制度。

《计算机科学与工程学院实验课程教学管理规定》

《计算机科学与工程学院实验室工作管理条例》

《计算机科学与工程学院实验中心主任、副主任职责》

《计算机科学与工程学院实验中心值班管理规定》

《计算机科学与工程学院实验室开放管理规定》

《计算机科学与工程学院关于实践教学分工和实施的规定》

《计算机科学与工程学院实验室仪器设备管理制度》

《计算机科学与工程学院实验室大型精密仪器设备管理办法》

《计算机科学与工程学院实验室低值仪器设备管理办法》

《计算机科学与工程学院实验室仪器设备损坏、丢失赔偿制度》

《计算机科学与工程学院计算机实验室管理制度》

《计算机科学与工程学院关于外出实习学生管理规定》

《计算机科学与工程学院外出实习指导教师规范》

《计算机科学与工程学院认识实习管理规范》

《计算机科学与工程学院生产实习规范》

《计算机科学与工程学院学生用机规定》

5、中心根据实验室管理和实验教学的具体实际，也制定了若干管理办法。

《实验教师手册》

《实验教学督导考核管理办法》

《实验教师及技术人员培训管理办法》

《学生实验手册》

《实验室开放管理办法》

《开放创新实验管理条例》

《物品管理办法》

《实验室管理制度》

《实验室安全管理制度》

《实验环境管理规定》

《安全用电须知》

《学生实验考勤制度》

《学生实验成绩考核办法》